تم اعتماد مجلس الكلية وعقد اول مجلس بتاريخ 14 اغسطس للعام 2022 وقد تراس المجلس الاستاذ الدكتور مصطفى عبد الخالق رئيس الجامعة وعميد كلية الصيدلة فى هذا الوقت الاستاذ الدكتور مجدى محمد امين. ويتم عقد هذا المجلس شهريا لمناقشة كافة الامور الخاصة بالكلية ومناقشتها واتخاذ القرار المناسب بالموافقة او الرفض ويضم المجلس الاستاذ الدكتور علام محمد عبد المنعم عميد الكلية الى جانب السادة رؤساء الاقسام واقدم مدرس بالكلية .